云南中醫學院創建于1960年，是全國第二批成立的高等中醫藥本科院校。1986年獲準為碩士學位授權單位，2009年列為云南省省級立項建設博士授予單位。
學校堅持以中國特色社會主義理論體系為指導，全面貫徹黨的教育方針，堅持立德樹人、促進學生全面發展、終身發展的教育理念，以中醫藥為主體，積極發展民族醫藥，引領云南中醫藥發展，服務國家和云南健康事業與產業發展，造福人類健康。
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學校不斷推進國際交流與合作，招收美國、澳大利亞、日本、泰國、越南等10余個國家和港澳臺地區學生。與西班牙、澳大利亞、泰國、越南等國家和地區的25所大學、醫療和科研機構建立了合作關系，開展教學、醫療和科研的交流與合作。是云南省第一家在境外開展專業教育的高校。
在50多年辦學歷程中，學校秉承“崇德和合、博學敦行”的校訓，以服務地方經濟社會發展為己任，人才培養成效顯著，師資結構持續優化，辦學特色日益凸顯，科研實力明顯增強，產學研結合特色鮮明，辦學影響力顯著提高，綜合辦學實力不斷增強，正向著區域有影響力的高水平中醫藥院校目標邁進。
